V tomto článku sú predstavené dve základné aminokyseliny, glycín (Gly) a alanín (Ala).Je to hlavne preto, že môžu pôsobiť ako základné aminokyseliny a pridanie skupín k nim môže generovať iné druhy aminokyselín.
Glycín má zvláštnu sladkú chuť, preto jeho anglický názov pochádza z gréckeho glykys (sladký).Čínsky preklad glycínu má nielen význam „sladký“, ale má aj podobnú výslovnosť, ktorú možno nazvať modelom „vernosti, úspechu a elegancie“.Kvôli svojej sladkej chuti sa glycín často používa ako dochucovadlo v potravinárskom priemysle na odstránenie horkosti a zvýšenie sladkosti.Bočný reťazec glycínu je malý s iba jedným atómom vodíka.To ho robí iným.Je to zásaditá aminokyselina bez chirality.
Glycín v proteínoch je charakteristický svojou malou veľkosťou a flexibilitou.Napríklad trojvláknová špirálovitá konformácia kolagénu je veľmi špeciálna.Na každé dva zvyšky musí byť jeden glycín, inak spôsobí príliš veľkú stérickú prekážku.Podobne spojenie medzi dvoma doménami proteínu často vyžaduje glycín, aby sa zabezpečila konformačná flexibilita.Ak je však glycín dostatočne flexibilný, jeho stabilita je nevyhnutne nedostatočná.
Glycín je jedným zo spojlerov pri tvorbe α-helixu.Dôvodom je, že bočné reťazce sú príliš malé na to, aby vôbec stabilizovali konformáciu.Okrem toho sa glycín často používa na prípravu roztokov pufrov.Tí z vás, ktorí robia elektroforézu, si to často pamätajú.
Anglický názov alanínu pochádza z nemeckého acetaldehydu a čínsky názov je zrozumiteľnejší, pretože alanín obsahuje tri uhlíky a jeho chemický názov je alanín.Toto je jednoduchý názov, rovnako ako charakter aminokyseliny.Bočný reťazec alanínu má iba jednu metylovú skupinu a je o niečo väčší ako reťazec glycínu.Keď som nakreslil štruktúrne vzorce pre ďalších 18 aminokyselín, pridal som k alanínu skupiny.V proteínoch je alanín ako tehla, bežný základný stavebný materiál, ktorý si s nikým nekoliduje.
Bočný reťazec alanínu má malú prekážku a nachádza sa v α-helixe, čo je konformácia.Je tiež veľmi stabilný, keď je β-skladaný.V proteínovom inžinierstve, ak chcete zmutovať aminokyselinu bez špecifického cieľa na proteíne, môžete ju vo všeobecnosti zmutovať na alanín, čo nie je ľahké zničiť celkovú konformáciu proteínu.
Čas odoslania: 29. mája 2023