Tieto antimikrobiálne peptidy boli pôvodne odvodené z obranných systémov hmyzu, cicavcov, obojživelníkov atď., a zahŕňajú najmä štyri kategórie:
1. cekropín bol pôvodne prítomný v imunitnej lymfe Cecropiamotha, ktorý sa nachádza najmä v inom hmyze a podobné baktericídne peptidy sa nachádzajú aj v črevách ošípaných.Typicky sú charakterizované silne alkalickou N-koncovou oblasťou, po ktorej nasleduje dlhý hydrofóbny fragment.
2. Antimikrobiálne peptidy Xenopus (magainín) pochádzajú zo svalov a žalúdka žiab.Zistilo sa tiež, že štruktúra xenopus antimikrobiálnych peptidov je špirálovitá, najmä v hydrofóbnom prostredí.Konfigurácia xenopus antipeptidov v lipidových vrstvách bola študovaná NMR na pevnej fáze s NMR.Na základe chemického posunu acylamínovej rezonancie boli helixy antipeptidov xenopus paralelné dvojvrstvové povrchy a mohli sa zbiehať, aby vytvorili 13 mm klietku s periodickou špirálovou štruktúrou 30 mm.
3. defenzín Obranné peptidy sú odvodené z ľudských polykaryotických neutrofilných králičích polymakrofágov s kompletným jadrovým lalokom a črevnými bunkami zvierat.Skupina antimikrobiálnych peptidov podobných obranným peptidom cicavcov bola extrahovaná z hmyzu, nazývaná „peptidy na ochranu proti hmyzu“.Na rozdiel od obranných peptidov cicavcov sú obranné peptidy proti hmyzu aktívne iba proti grampozitívnym baktériám.Dokonca aj peptidy na ochranu proti hmyzu obsahujú šesť zvyškov Cys, ale spôsob vzájomnej disulfidovej väzby je odlišný.Spôsob viazania intramolekulárnych disulfidových mostíkov antibakteriálnych peptidov extrahovaných z Drosophila melanogast bol podobný ako u rastlinných obranných peptidov.V kryštalických podmienkach sú obranné peptidy prezentované ako diméry.
4. Tachyplezín je odvodený od podkovovitých krabov, nazývaných podkovár.Konfiguračné štúdie ukazujú, že používa antiparalelnú konfiguráciu skladania B (3-8 pozícií, 11-16 pozícií), v ktorejβ-uhol je navzájom spojený (8-11 polôh) a medzi 7 a 12 polohami a medzi 3 a 16 polohami sa vytvoria dve disulfidové väzby.V tejto štruktúre je hydrofóbna aminokyselina umiestnená na jednej strane roviny a šesť katiónových zvyškov sa objavuje na chvoste molekuly, takže štruktúra je tiež biofilná.
Z toho vyplýva, že takmer všetky antimikrobiálne peptidy majú katiónovú povahu, aj keď sa líšia dĺžkou a výškou;Na high end, či už v podobe alfa-helikálnej respβ- spoločným znakom je skladacia, bittropická štruktúra.
Čas odoslania: 20. apríla 2023