Peptidy prenikajúce do buniek sú malé peptidy, ktoré môžu ľahko preniknúť cez bunkovú membránu.Táto trieda molekúl, najmä CPP s funkciami zacielenia, je prísľubom pre účinné dodávanie liečiva do cieľových buniek.
Výskum na ňom má preto určitý biomedicínsky význam.V tejto štúdii boli CPP s rôznymi transmembránovými aktivitami študované na sekvenčnej úrovni, snažiac sa zistiť faktory ovplyvňujúce transmembránovú aktivitu CPP, sekvenčné rozdiely medzi CPP s rôznymi aktivitami a NonCPP a zaviesť metódu na analýzu biologických sekvencií.
Sekvencie CPP a NonCPPs sa získali z databázy CPPsite a rôznych literatúr a transmembránové peptidy (HCPP, MCPP, LCPP) s vysokou, strednou a nízkou transmembránovou aktivitou sa extrahovali zo sekvencií CPP na vytvorenie súborov údajov.Na základe týchto súborov údajov boli vykonané nasledujúce štúdie:
1, Aminokyselinové zloženie a zloženie sekundárnej štruktúry rôznych aktívnych CPP a NonCPP boli analyzované pomocou ANOVA.Zistilo sa, že elektrostatické a hydrofóbne interakcie aminokyselín zohrávali dôležitú úlohu v transmembránovej aktivite CPP a špirálová štruktúra a náhodné zvinutie tiež ovplyvnili transmembránovú aktivitu CPP.
2. Fyzikálne a chemické vlastnosti a dĺžky CPP s rôznymi aktivitami boli zobrazené na dvojrozmernej rovine.Zistilo sa, že CPP a NonCPP s rôznymi aktivitami by mohli byť zoskupené pod niektorými špeciálnymi vlastnosťami a HCPP, MCPP, LCPP a NonCPP boli rozdelené do troch zoskupení, čo ukazuje ich rozdiely;
3. V tomto článku je predstavený koncept fyzikálneho a chemického ťažiska biologickej sekvencie a zvyšky tvoriace sekvenciu sú považované za časticové body a sekvencia je abstrahovaná ako časticový systém pre výskum.Táto metóda bola aplikovaná na analýzu CPP projektovaním CPP s rôznymi aktivitami do 3D roviny pomocou metódy PCA a zistilo sa, že väčšina CPP sa zoskupila a niektoré LCPP sa zoskupili spolu s NonCPP.
Táto štúdia má dôsledky pre návrh CPP a pochopenie rozdielov v sekvenciách CPP s rôznymi aktivitami.Okrem toho metóda analýzy fyzikálneho a chemického ťažiska biologických sekvencií uvedená v tomto článku môže byť použitá aj na analýzu iných biologických problémov.Zároveň sa dajú použiť ako vstupné parametre pre niektoré problémy biologickej klasifikácie a zohrávajú úlohu pri rozpoznávaní vzorov.
Čas odoslania: 15. júna 2023